circlncRNAnet -一个集成的基于web的资源,用于映射长形式或圆形非编码rna的功能网络兴发亚洲唯一官方网站

尽管它们缺乏蛋白质编码的潜力,xf187 PT游戏lncrna和环状rna已经成为基因调控的关键决定因素,用于微调转录和信号输出。已知这些非编兴发亚洲唯一官方网站码RNA转录本通过表观遗传和转录后调控影响信使RNA (mrna)的表达。考虑到它们广泛的目标光谱和广泛的作用方式,对其生物学相关性的全面了解将取决于对各级系统数据的综合分析。

虽然已经报告了一些公开可用的数据库,现有工具无法完全捕获,从网络的角度来看,感兴趣的lncRNas或circRNas的功能含义。xf187 PT游戏通过一体化和流线型的设计,circlncRNAnet的目的是通过在硅酸盐中测试基于ncRNA功能的几个假设来拓宽对ncRNA候选基因的理解,基于大规模RNA-seq数据。该web服务器的实现具有以下几个特点,代表了ncrna生物信息学的进步:1)灵活的框架,接受和处理用户定义的基于ngs的表达数据;2)多个分析模块,通过交叉引用广泛整理的数据库,对用户选择的ncrna的调控网络进行分配和有效评估;3)多用途,信息丰富的工作流设计,适用于所有类型的ncrna。表达式配置文件上的输出,共表达网络与通路,和分子interactomes,根据用户定义的标准动态和交互式地显示。

circlncRNAnet的总体设计和分析流程

rna-seq简而言之,用户可使用circlncRNAnet在真正的时间,关于他们感兴趣的环状rna / lncrna的多种功能相关信息。xf187 PT游戏总之,circlncRNAnet为深入分析ncRNA生物学提供了“一站式”资源。

可用性- circlncRNAnet可于http://app.cgu.edu.tw/circlnc/

吴SM,刘H,黄PJ,Chang IY,李CC,杨CY,蔡WS,公元前谭。(2017) circlncRNAnet:一种集成的基于web的资源,用于映射长形式或圆形非编码rna的功能网络兴发亚洲唯一官方网站Gigascience[Epub before print]。( 摘要]

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