部落格博客xf187 PT游戏 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bbLog.com LNCRNA研究与行业新闻兴发亚洲唯一官方网站 太阳09十二月2018日14:30:18+ 0000 恩努斯 每小时 HTTPS://WordPress?Org/?V= 4.7.12 xf187 PT游戏LncRNA作为抗体生产中细胞系工程的工具 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COxf187 PT游戏M/LNCRNAS-AS-Tooer-Fiel-Lin工程在反生产中的应用 http://www. LncNabxf187 PT游戏ab.com/Lnxf187 PT游戏cRNA作为抗体生产中细胞系工程的工具/响应 坐,01十二月2018日15:49∶19+ 0000 网络管理员 综述论文 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7780 中国仓鼠卵巢细胞是目前用于生产重组蛋白生物制药的主要哺乳动物细胞表达系统。在生物反应器中确定细胞可达到的生物量的关键过程之一是从这种系统中获得重组蛋白的产量和质量。翻译是核糖体和相关的过程。 “CDN.CON/I2211381831893-FX1YLLG.JPG”目标=“空白”Re=“NoNoPER NOREFER”>“大小为满WP-图像-77 72对齐中心”SRC=“HTTPS://www. LncNabab.CON/WP-内容/上载/2018/12/Eng.jPG”ALT=“LNCRNA”宽度=“800”高度=“731”SRCSET=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/WP CONTE”< div alixf187 PT游戏g=“正当”> < p> < HRFF=“HTPSP:/ARS.ELS”NT/上载/2018/12/Eng.JPG 800 W,HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com /WP CONTRON/XOPADDS/2018/12/Eng-300 X74.JPG 300 W,HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com /WP CalpTuns/AppAddis/2018/12/Eng768 X702.JPG 768 W,HTTPS://www. LnCRNxf187 PT游戏abLog.COM/WP CONTRON/XOPADS/2018/12/EnG-640X585.JPG 640W“大小=”(最大宽度:800 px)100VW,中国的仓鼠卵巢细胞是目前用于制备重组蛋白生物制药的主要哺乳动物细胞表达系统。在生物反应器中确定细胞可达到的生物量的关键过程之一是从这种系统中获得重组蛋白的产量和质量。翻译是核糖体和相关的细胞机器解码mRNA产生多肽的过程。近年来,不同种类的非编码RNA在控制全局和转录特异性mRNA翻译中的作用也逐渐显现出来。兴发亚洲唯一官方网站这里的研究者从<HRFF=“HTTPS://www. kt.Ac.UK/Biope/Realths/Deix.HTML”目标=“空白”Re=“NoNoReer-NordeFror”>肯特大学</A>审查翻译工程机械和非编码RNAs的方法,兴发亚洲唯一官方网站在CHO细胞中特别长的非编码RNA和兴发亚洲唯一官方网站TrRNA,然后概述了这些方法从CHO和其它哺乳动物细胞表达系统中革命性地改变重组蛋白产量和质量的挑战和潜力。<D/P > DIV类=“盒阴影”> DIV类=“盒内块”> I类=“TiICON BOXICON”> </I> Vito D,Smales CM。(2018)<细胞翻译机器和非编码RNA增强CHO细胞生长的工程>兴发亚洲唯一官方网站重组产品产量和品质<强>。E.Curopop-Chan-Eng/Em>22(1):1992~208。[HaRf://www-SisturnDist.com/Simule/PiI/S221139818333 9 ]目标=“空白”Re=“NoNoReer-NoeFror”>抽象< /DI>>/div > /div > IMG-SRC=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/?”后置ID=7780“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COxf187 PT游戏M/LNCRNAS-AS-Tooer-Fiel-Currin in EndobdioDealth/Foe//Curror CISPI——揭示顺式作用疾病相关基因的转录组分 HTTPS://www-LncNabxf187 PT游戏abLog.COM/CISPI-A转录本-得分-披露-顺式-疾病-关联LNCRASN/ http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /CISPI-A转录本-分录-顺式-疾病关联的LcRNAS/α响应 清华大学,15 NoV 2018 19:40:27+0000 网络管理员 注释 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7773 长基因间非编码RNAs(LeCrNAS)在癌症生物学中已成为重要的疾病生物标志物。从活性顺式调控元件(增强子)转录的那些LcRNs为CIS作用提供了机械的洞察。 <PialAlg=“正当”> <P>长基因间非编码RNAs(LeCrNAS)在癌症生物学中已成为重要的疾病生物标志物。从活性顺式调控元件(增强子)转录的那些LcRNs为CIS作用调节提供了机械的洞察;然而,在没有增强标志的情况下,计算预测的顺式作用转录的LeCnRNA仍然具有挑战性。在这里,< HREF=“HTPSE//PalcReal.UCHICAGO.EDU//”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>芝加哥大学</A>研究人员介绍了一种新的转录组学方法:顺式调控的LcRNA基因关联度量,被称为“CISPI”。CISPI量化lincRNAs和局部基因表达之间的相互作用,关于它们对扰动的反应,如疾病风险依赖性。预测神经母细胞瘤的危险相关基因一个攻击性的儿童癌症,研究人员通过一个新的并列的分析管道来检测这个在RNA-SEQ文库中代表少数阅读的LcRNAs。</P> < P>改变肿瘤风险的LcRNAs的表达是致癌增强活性的信息读出。因此,CISPI度量提供了一个强大的计算模型来识别增强子模板RNAs(ErNAS),像lincRNAs一样,或调节局部基因表达的活性增强剂。第一,依赖风险的LcRNA显示活性增强剂,过度表达的神经母细胞瘤易感性位点并发现了新的临床生物标志物。第二,优先化的LcRNNA具有显著的预后。第三,预测的靶基因进一步继承了这些基因的预后意义。总而言之,RNA Seq单独使用我们的方法足以识别疾病相关的LcRNA。允许更广泛的应用到上下文中的增强子标记不可用或显示有限的灵敏度。</P> P风格=“文本对齐:中心;>强> CISPI度量不仅优先于表型相关的林肯基因<BR/>但预测的靶基因LIcRNAS< <强> </P> < P> < HHTPS://Actui.OUP.COM/VIEW-LARGE/FIGUL/121106563/B。TY57F3.TIF“目标=”“空白”Re=“NoPENER NOREFER”>“WP-图像-24948大小全对齐中心”SRC=“HTTPS://www. RaN-SqBL.G./WAP-CONTRON/XOPADS/2018/11/CISPI.JPG”ALT=“ReaSeq”宽度=“800”高度=“1052”/> </A> < /P> < P> <(强> A1)<强>密度图显示五种类型的LCNR-基因对的Spearman系数68个样品。xf187 PT游戏垂直虚线是R=0.6的意义截断,其中从随机控制(虚线)发出的信号。风险依赖的相邻对呈正相关比例最高。(强>A2)<强> HeX-BIN图显示了识别的LcRNA(X轴)和基因(Y轴)的一致风险依赖性。(<强> C)<强>稀疏散点图对两种CISPI评分的影响一个建模相邻目标(Y轴),并在TAD(X轴)内对所有潜在目标建模。橙色对角线表示Y==x,用两条虚线表示标准偏差。注释的LcRNAS用最近的“靶”基因的名称标记。水平虚线表示优先级的10%截断(CISPI<10或>40)。(<强> B)<强>人类基因组中34个优先化的LcRNAS的CARCOS图注意到14小时上调基因(红色)和10小时下调基因(蓝色)坐在相邻或在TAD。(c)独创性路径分析(IPA),一类=“链接链接URI”=“Hopp://www. InEnuth.com”目标24个预测的靶基因(P<0.001),显示了丰富的疾病和功能(P53<0.001),上游调节分子(面板2)</EM> < /P> < P> <强>可用性< /强> -源代码可在请求中获得美国东部时间。优先化的LcRNAS及其靶基因位于“HTHPS:/OUP SILVICK-CDN.COM/OUP/BACKFIL/CONTRONEPARTION/JORBAL/BIONDATABICS/34 /17/10 1093A生物信息学BTY572/2/BTY574辅助材料PDF?Expires=1542404075&Signature=BTqgeAwuFKat0UjwSeJh3IEM-W~yFXqtJYq9uhbUd0qT55ofWYSP5pvCpRzMVxSP5-DSLMiHJxCekc1F8kkmq0pJsrYMDXoIPB9iL2oVcEYkAadHANXulMix44NzvATdFFvtFTwqSkSZ9Pv7HgvlPM-16uA4whaFtnYs64Iu9tFTUtNfjaEb~RKa9ek45s-XrxtGsxa7IBPlHZjMmzQCBbwD5oLrGoud5brfIj4fTY4QkvKXgPwE8~t0cHhrq1tiXOsn6xayIRqY5WcAb-Om7rFAZJ~BpQTkHvxqI6uFvNUkh396UPaGQZVgBwmt9waEFKPS~WXJFFV3KVX4HY-WYY&Key对ID=AKAKIE5G5CRDK6RD3PGA“目标=“空白”Re=“NoNoPER NOREFER”>补充材料</A> <div/> > DIV类=“box阴影”> div类=“框内块”> i类=“TiICON BOXICON”> </I>王Z,Cunningham JMYang XH。(2018)<强> CISPI:揭示顺式作用疾病相关的林肯< <强> ><EM >生物信息学< /EM>34(17):I66~I670。[HaRf://Actui.Up.COM/BiopyActus/ToeLe/34/17/I66/5093247 ]目标=“空白”Re=“NoNoReer-NoeFror”>文章< /DI>>/div > /div > IMGSRC=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/”?后置ID=7773“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www-LncNabxf187 PT游戏abLog.COM/CISPI-A转录本-得分-披露-顺式-疾病关联的LNCRASN/FEEP/ RNA SEQ识别长的非编码RNA作为炎症的关键调节因子 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/RNA-Seq识别-长非编码-RNAS AS-KY调节器-炎症/ http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /rNa-SEQ识别-长非编码-RNAS AS-KY调节器-炎症/γ应答 星期二,06 NoV 2018 23∶01:16+ 0000 网络管理员 评论 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7768 新的发现增加了越来越多的证据表明先前被丢弃的“垃圾DNA”实际上产生了具有重要调节功能的RNA分子。科学家已经鉴定出一种具有广泛能量的RNA分子来调节身体的炎症。 < HRFF=“HTPS:E/U/2018/11/IMAS/Fig-410JPG”兴发亚洲唯一官方网站目标=“IMAG类=“对齐中心WP-图像-2.38大小完全”SRC=“HTTPS://www. RaN-SqBul.com /WP-内容/上载/2018/11/L.C.JPG”ALT=“RNA SEQ”宽度=“410”高度=“411”/> </A> </P> < P> < EM >新发现增加了越来越多xf187 PT游戏的证据< div alig=“证明”> <P>“废弃DNA”实际上产生了具有重要调节功能的RNA分子</EM> </P> < P>科学家已经鉴定出一种具有广泛能力的RNA分子来调节机体对感染和损伤的炎症反应。被称为LYCRA-COX2,它属于最近发现的,高度丰富的RNA类,其功能才刚刚开始被理解。</P> < P>人类基因组的测序显示,我们染色体中只有一小部分DNA包含编码蛋白质的指令基因。这些基因被转录成信使RNA,它指导在细胞中实现各种功能的蛋白质的合成。基因组的其余部分,大约98%,在过去的十年中,有时被称为基因组的“暗物质”,或被称为“垃圾DNA”。然而,<强>新的RNA测序技术</Stult>揭示了许多基因组被转录成不同类型的非编码RNA分子。长基因间非编码RNA(LNCRNA)是这些RNA中最大的一类。</P>< BuffQue>> P>“我们现在知道大约16000个长的非编码RNAs,大约有蛋白质编码基因,但我们知道它们不到百分之一的功能。”Susan Carpenter说。AHEFF =“HTTPS://MCDUCSC.EDU//”目标的助理教授=“空白”Re=“NoNeNeer-NordeFror”>分子,UC圣克鲁斯的细胞和发育生物学< < /P> < / BuffQue> > P> Carpenter实验室对LcRNAS如何控制炎症过程进行了研究。新研究< HeRF=“http://www. com /Cell Real/FultExt/S2211-1247 % 2818% 931603-6”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”> 11月6日发表在<EM>细胞报告</EM> < /A>表明LNCRA- COX2在调节炎症和其他免疫系统反应中的活性方面有不同的作用。</P> < P> <强>炎性基因<BR/><强> </P> < P>炎症是机体对感染和损伤反应的正常部分,但未解决或慢性炎症与广泛的疾病有关。LYCRA-COX2基因在基因组中被命名为COX2基因,Carpenter称之为“体内最重要的炎症基因”。布洛芬,其他非甾体抗炎药(NSAIDs)通过抑制由该基因编码的COX2酶而减少炎症。< / P > P >本研究的主要发现之一是,LNCRA- COX2调节了该邻近基因的活性,促进酶的生产。Carpenter的研究小组发现,在缺乏LNCR-COX2基因的小鼠中,COX2酶的水平低于正常值的70~80%。</P> < P>但COX2不是由LCNCR-COX2调控的唯一基因。它也影响整个基因组中分散的基因的表达,这些其他基因在感染的先天免疫反应中很重要。LYCRA-COX2对某些基因有抑制作用,增强了其他基因的表达。Carpenter实验室和其他实验室的前期工作显示了这些在细胞培养中的作用,但是这项新的研究使用转基因小鼠来检测LICRA-COX2对活的动物中的COX2基因和其他免疫系统基因的影响。Carpenter说:“这可能是第一个显示LcRNA不仅控制邻近基因,而且还控制其他基因的例子之一。”</P> </BuffQu>> P> <强>病毒感染< /强> </P>:P>一个功能是抑制病毒I的先天免疫应答中重要的一些基因的表达。婚恋。“当你感染的时候,你希望这些基因打开,但是,当他们在没有感染的情况下被激活时,它与狼疮等自身免疫性疾病有关,”Carpenter说。</P> < P > Carpenter的团队还用小鼠模型来研究不同组织中的LycNa -COX2的表达。他们发现,例如,它在肺组织中非常活跃,这表明它可能在呼吸道感染中起作用。在今后的工作中,研究人员计划更仔细地研究LycNa -COX2在特定细胞类型中的活性。</P>< BuffQue>>P>”这个领域是如此新奇,起初有很多怀疑论,但我们现在看到这些基因是非常重要的,”Carpenter说。“细胞产生RNA所需的能量比蛋白质少,因此,有许多调节分子是RNAs的。“</p></BuffQu>> P >医学研究人员迫切希望了解这些非编码RNA分子的功能。随着基因组测序的爆炸式增长,生物医学科学家已经进行了许多全基因组关联研究(GWAS)来识别与疾病相关的遗传变异。但在这些研究中发现的大多数与疾病相关的遗传变异都不在蛋白质编码基因中。</P> < BuldQuut>> P>”,结果发现其中97%个位于基因组的非编码区,“Carpenter说。这是一个原因,人们对这些非编码RNA基因非常感兴趣。“</P> < /BuffQue> < P>源:< HRTF=“HTPS://NUC.EUU/2018/11/LIC-RNA.HTML”目标=“NoLeuner-NoeFror”> UC圣克兴发亚洲唯一官方网站鲁斯< /A> < /P> DIV类=“box阴影”> DIV类=“Box内块”> I类=“TiICON BOXICON”> </I> ErrR,鲁滨孙埃克Shapleigh B林恩JL凯瑟琳AFitzgerald KA木匠(2018)<强>遗传模型揭示了LICRA-COX2</Stult>顺式和跨膜免疫调节活性。<E>细胞ReP/E> >打印前的EPUB。[HReF==“http://www-com .com /Cell Reals/FultExt/S2211-1247(18)31603-6)?O.ReTurnLy= HTTPS%2F%2FLink Guang.Eclivi.2FrutHist% %2FPII %2FS221112718316036% 3fStuff% %3Dtruts“目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>文章< /DI>>/div > /div > IMTSRC=“http://www. LncnabLog.com/?后置ID=7768“宽度=1”高度=“1”样式=xf187 PT游戏“显示:无”; HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/RNA-Seq识别-长非编码-RNAS AS-KY调节器——炎症/馈电/ CWRU接受NIH资助研究抗结直肠癌的基因 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/CWRU接收-NIH-Fun-to研究 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /cWRU接收NIH资助来研究抗结直肠癌的基因 清华大学,27 SEP 2018 12:35:53+ 0000 网络管理员 新闻稿 凯斯西储大学 结直肠癌 无缝线路 林肯公司 国立卫生研究院 国立卫生研究院补助金 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7760 靶向长的非编码RNA可能会比传统方法提供更多的益处。 <D> Alq=“P>>EM>靶向长非编码RNA可能与传统方法</EM>/P>> P >相比,已知某些编码蛋白质的基因长期以来对癌症的进展有贡献。但是在一个框架转换中,研究者从<HRFF=“HTTPS://CAS.EdU/MealdiNe/”目标=“空白”Re=“NoNeNeer-NordeFror”>凯斯西储大学医学院</A>最近发现非编码基因也有助于疾病的发展和蔓延,兴发亚洲唯一官方网站研究者的第一个已知例子之一。</P> < P>研究报告的主要作者报告了这一发现,Ahmad Khalil博士学位,凯斯西保留医学院遗传学和基因组科学助理教授被授予五年,美国国立卫生研究院拨款185万美元用于发现在新的资助下,最终确定了癌症治疗的额外目标。</P> < P>哈利勒WHO也是综合癌症中心的成员,将寻求了解非编码基因如何在结直肠癌的进展中起作兴发亚洲唯一官方网站用。这一知识可以应用于设计新的治疗方法,这是影响男性和女性癌症的癌症相关死亡的第二大原因。</P> < P> messenger RNAs(MRNs)携带细胞从DNA中制造蛋白质的指令,另一类RNA,长非编码RNAs(LNCRNAS),不要为蛋白质编码。在来到西部储备之前,哈利勒发现人类基因组编码了数以千计的这些基因,调节细胞功能的关键,包括打开和关闭编码基因,细胞发育与分化正常细胞死亡(凋亡)。“癌症领域的重点是编码RNAs及其蛋白产物在疾病发展中的作用,”哈利勒说。“这是,仍然是一个重要的调查领域。但在我们最近的研究中,我和我的同事们已经证明,一些LncRNA似乎也帮助结肠癌细胞避免细胞死亡,并以比正常人快得多的速度增长。这一发现开辟了一个平行的癌症斗争轨道,可以显著增加克服这种有害疾病的机会。哈利勒在肿瘤细胞中的水平高于正常结肠细胞中的水平,鉴定出超过200种不同的LcRNA。一,叫做林克苏普,在91%的结肠肿瘤标本中不成比例地存在,在某些情况下超过正常结肠组织的十五倍。这有力地暗示了这种以前鲜为人知的RNA形式可能参与结肠癌的形成和扩散的可能性。为了检验这个假设,哈利勒和他的团队通过消耗LICDUSPP的量来对结肠癌细胞进行基因改造。他们发现细胞开始以正常速率复制,不是结肠癌肿瘤细胞的过度活跃率,</P> < P>遗传降低LeCdSUP的水平,以及潜在的应用化学药品或药物来做同样的工作,目前,我们发现LcRNA在结肠癌中起着关键作用,我们的新资助下的目标是了解它们是如何导致疾病的,所以我们可以设计治疗方法,”哈利勒说。“我们想了解RNA的结构和功能。我们还将研究与细胞中其他分子相互作用的潜在作用,这些分子有助于癌症的发生。哈利勒说,是因为他和他的团队发现,当他们通过使用与RNA结合的某些化学化合物来调节人类肿瘤中RNA的表达水平时,长非编码RNA的降解迅速发生。兴发亚洲唯一官方网站这些化合物以前没有用于人类癌症治疗。从长远来看,哈利勒设想通过改善递送机制来靶向人肿瘤中的LcRNA,这可以为临床试验提供基础。在其他发表的研究中,他和同事已经证明,LeCnAs会影响其他癌症,包括乳腺癌,肺黑色素瘤。因此,哈利勒说:“这些新的方法可能会产生广泛的影响。</P>< BuffQue>>P>”关于长链非编码RNA在结肠癌中的作用的文献正在缓慢地涌现,具有令人兴奋的可能性。兴发亚洲唯一官方网站“在我们的新范式下,使用靶向RNA分子的技术,代替蛋白质,在抗癌方面增加了一个新的维度。“</P><BLASKQUE> < P>源”< HRFF=“HTTP:/CaseMe.CaseEdU/CWRUMED360/NeX-RelaseS/Relase.CFM?”NexSydID=1461和NedivyCy兴发亚洲唯一官方网站pe=8“目标=“空白”Re=“NoNoPER NoeFror”>凯斯西储大学< /A> < /P> </div > IMTSRC=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/?”后置ID=7760“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/CWRU接收-NIH-Fun-to研究 UPA-SEQ——利用紫外交联的差异灵敏度预测功能性LncRNAxf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/UPA-SEQ预测函数-LNCRNAS-USER差分灵敏度-Uxf187 PT游戏V-交联 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /uPA-SEQ预测功能性LncRNA对UV交联/γ响应的差异敏感性xf187 PT游戏 清华大学,27 SEP 2018 12:25:32+0000 网络管理员 LncRNA检测 LNCRNA发现 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7753 虽然大量长的非编码RNAs(LNCRNs)是从高等真核生物基因组转录而来的,xf187 PT游戏由于缺乏保守的序列基序或结构,它们的功能的系统预测一直具有挑战性。 <DIIALIGN=“正当”>P>而大量长的非编码RNAs(LNCRNs)是从高等真核生物基因组转录而来的,xf187 PT游戏由于缺乏保守的序列基序或结构,对其功能的系统预测一直具有挑战性。假设某些LncRNAS起着大的核糖核蛋xf187 PT游戏白复合物的作用,因此容易在紫外线照射下与蛋白质交联,< HREF=“HTTPS://www. Gualal.HokUdA.A.JP/”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>北海道大学</A>研究人员对UV照射后的水相回收的RNA和酚-氯仿提取(UPA-SEQ)进行RNA SEQ分析。果不其然,在UV照射下,UPA-SEQ读数映射到已知的功能性LncRNA显著减少。xf187 PT游戏与编码ECRIP数据的比较显示,在UV照射下表现出更大的减少的LncRNA优先与含有朊病毒样结构xf187 PT游戏域(PRLDS)的蛋白质相关联。荧光原位杂交(FISH)分析揭示了新的功能性LncRNA候选基因的核定位,包括在转录位点积累的一种。研究人员提出,UPA-SEQ为后续功能研究中选择的LNCRNA候选序列提供了一个有用的工具。</P> < P风格=“文本对齐:中心”>强>新的功能性LNCRNA候选物的UPA-SEQ </Surviv> </P> < P> < E> < HRF= =“HRTF//RNaNealal.CsHLP.Org/ CalpNe/Eury/2018/09/19 / RNA“67611.118”长“目标=”Re=“NoReuner-NoeFror”>“大小满WP图像-775 5个对齐中心”SRC=“HTTPS://www. LncNabab.com /WP-内容/上载/2018/09/UPA.PNG”ALT=“LNCRNA”宽度=“800”高度=“1081”SRCSET=“HTTPS://www. LnCRNabab.COM/WP-内容/上载/2018/09/UPA.PNG 800 W,xf187 PT游戏HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com /WP Corduns/PosialDS/2018/09/UPA-222x300 .pNG 222W,HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/UPA-768 X1038PNG 768 W,HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/UPA-78X1024.PNG 75 8W,HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/UPA-640X865.PNG 640W“大小=”(最大宽度:800 px)100VW,在培养基和HEPG2细胞中,紫外线照射后,相对丰度的函数(Log10,BaseMeAs)的对数×2倍的变化,为800 px“/>(a)< /强> MA图。浅绿色DOTS代表具有显著(FDR<0.05)折叠变xf187 PT游戏化的LncRNa,橙色DOTS代表用于以下鱼类研究的功能性LNCRNA候选者,暗绿色点代表已知的功能性LncRNA。xf187 PT游戏请注意,只有负NLCRON2具xf187 PT游戏有负变化值。<强>(b)<强>紫外线照射后功能低下组(FDR<0.05)。基因被分为已知基因(注释)和未知基因,其ID号与各种前缀(RP,通用汽车公司交流电,和AL)。<强>d)/FISH>FISH图像,显示在HIPG2细胞(C)和HEPG2细胞(D)中功能性LNCRNA候选基因(绿色)的亚细胞分布。品红色表示用DAPI复染的细胞核。刻度尺10μm。示意图显示了Rab30/RP11-113K21.5位点的基因组织和探针同时检测的位置。注意,用检测RP11-113K21.5的探针获得的信号与探测Rab30内含子序列的探针所获得的信号密切相关。虚线代表核的位置。刻度尺10μm。<强>(f)< /强> 18S rRNA半衰期,MALAT1,NETAT1,RP11-113K21.5,RP11-46C20.1,和SNHG1,用BRIC RT-qPCR测定。值得注意的是,功能性LncRNA候选序列的半衰期相对较短。</EM> < /P> < div类=“盒影”> div类=“盒内块”>i类=“TiEICON BOXICON”></I>太瓦K,横河Mito MFujii K木村,岩崎中川美国(2018)<强> uPA-SEQ:利用UV交联的差异敏感性<强>预测功能性ncRNA。xf187 PT游戏<> RNA </EM> [EPUB]。[HeRF==“Htff./CsLP.Org/CalpTeN/2018/09/19/RN.067 611118.LUN”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>文章< /DI>>/div > /div > IMTSRC=“HTTPS://www-LnCRNabLog.COM/?”后置ID=7753“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/UPA-SEQ -预测函数-LNCRASN-USER差分灵敏度xf187 PT游戏-UV-交联/馈电/ 科学家揭示映射未知未知长RNA的方法兴发亚洲唯一官方网站 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com/科学主义-Real-Advay-MAP-广袤未知区域的长非编码RNA/兴发亚洲唯一官方网站 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /科学家揭示了映射长未知编码区域的长非编码RNA /γ响应的方法。兴发亚洲唯一官方网站 结婚,19 SEP 2018 20:00 :28+0000 网络管理员 评论 新闻稿 K-MeR 地图 塞克尔 北卡罗莱纳大学医学院 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7748 UNC医学院的研究人员已经开发出一种方法来将神秘的RNA分子按其可能的功能科学家分类。 “EurkKald.Obj/18080.PHP”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”> SRC=“HTTPS://www. LncnabLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/MAP.jPG”ALT=“LNCRNA”宽度=“720”高度=“694”SRCSET=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/MAP”< divxf187 PT游戏 alig=“正当”> < p> < HRFF=“HTTPS://www.”JPG 720W,HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/WP-内容/上载/2018/09/MAP300×X895.JPG 300 W,HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/WP CONTRON/XOPADS/2018/09/MAP640X617JP66W“大小=”(最大宽度:720Px)100VW,720px“/>a/< >/p><P> <强> UNC医学院研究人员已经开发出一种将神秘RNA分子按其可能的功能分类< <强> >/p> < P> >科学家们从< HRFF=“HTTPS://unCelnBurgel.Org/”目标=“空白”Re=“NoNoer-NordeFror”>北卡罗来那大学医学院</A>开发了一种强有力的方法。R探索长非编码RNAs(LNCRNs)的神秘分子的性质,xf187 PT游戏兴发亚洲唯一官方网站其中一些在癌症和其他严重的疾病中有很大的作用。到现在为止,科学家们缺乏正确的方法来识别人类细胞中产生的成千上万种不同的LncRNA的功能。xf187 PT游戏到目前为止,它们只表征了几百个这样的分子——它们所代表的巨大的未知地球的一小部分。</P> <P>发表在<En>自然遗传学< /EM >中。UNC科学家发现了一个隐藏的代码,将LNCRNs的分子组成与它们实际所做的联系起来,xf187 PT游戏研究人员开发了一种快速分类LNCRNs的算法,它们的可能功能是:</P>< BuffQue>>P>“长的非编码RNA是基因组的‘暗xf187 PT游戏物质’的一部分,兴发亚洲唯一官方网站我们开发的这个工具应该有助于我们更好地理解它们在健康和疾病中的作用,”研究论文的资深作者Mauro Calabrese说。博士学位,药理学助理教授和UNC莱茵伯格综合癌症中心成员。</P> < / BuffQue> > P>动物和植物中的遗传信息储存在DNA中,细胞利用遗传信息将DNA转录成与RNA密切相关的分子。许多RNA继续被翻译成蛋白质。但是近几十年来,科学家们不得不考虑这样的事实,即不到2%的基因组是这样使用的。大部分DNA被转录为不编码蛋白质的RNA。这些被称为非编码RNAs,兴发亚洲唯一官方网站长度超过200个核苷酸的基因被分类为长的非编码RNA。</P> < P>许多RNA与蛋白质或其他分子结合,以打开或关闭基因,兴发亚洲唯一官方网站从而调节细胞过程。其中一个最有名的LNCRNs被称为XIST,xf187 PT游戏这对女性的正常发育具有重要意义。高水平的另一种叫做马拉特,与更具侵袭性和转移性癌症有关。总的来说,生物学家确信,许多LNCRNs具有重要的调节作用,其破坏有助xf187 PT游戏于疾病。到目前为止,然而,它们的特征仅是在哺乳动物细胞中存在的成千上万种LncRNA的一小部分。</P> < P>一个原因,生物学家一直很难理解这些分子所做的是,当研究它是如何从核苷酸序列的序列中组装起xf187 PT游戏来时,LncRNA的功能并不容易显现。ING块。通常两个具有相似功能xf187 PT游戏的LncRNA似乎有非常不同的序列。</P> < P> Calabrese和他的团队,包括第一作者Jessime Kirk和Peter Mucha,博士学位,UNC艺术与科学学院数学与应用物理科学教授,试图破译LNCRNA序列与功能之间的另一种模糊关系。他们从两个关键线索开始:首先,有证据表明,LncRNa主要通过与蛋白质结合发xf187 PT游戏挥作用。其次,RNAs用它们的整体结构中的短序列连接到蛋白质。</P>< BuffQue>>P>“我们推断LncRNA中蛋白质结合序列的存在比它们在LNCRNA内的相对定位更重要,”Calabrese说。“这个想法最终是真的,并允许我们在更传统的方法失败的地方成功。“</P></BuffQue>P>”团队开发了一个“HRFF=”HTTP://Sekrr.Org/Head“目标=“空白”Re=“NoOnter NordeFror”>基于计算机的方法,称为SEEKR </A>查找并比较它们在LNCRNs中称为“KMES”的蛋白结合序列,xf187 PT游戏不管KMER的确切位置。研究小组发现,大约一半的人类和小鼠的LncRNA可以分为五个不同的群落,xf187 PT游戏基于他们的KME内容的相似性。基于KMER的方法也可以帮助预测细胞内LNCRNs通常在哪里找到,以及它们结合哪种蛋白质。xf187 PT游戏并用它来发现可能通过相关机制发挥作用的LncRxf187 PT游戏NA。在某种程度上,这就像能够最终理解罗塞塔石碑上的不同剧本一样。”Calabrese说。研究小组发现,KME含量群落在物种间往往高度相似。人和小鼠LncRNA群落紧密相似,但是一些哺乳动物LncRNA群落甚至在远缘动物中也有明显的同源性。一个哺乳动物LncRNA群落,由一个名为HoTip的LNCRNA表示在其他脊椎动物中,甚至在海胆中也有表亲LncRNA群落。Calabrese说,人类LNCRxf187 PT游戏As亚群可能比进化的遥远物种的LncRNA更类似于其他人类LNCRNs。这支持了LncRNA在不同生物体中具有相似功能的观点,尽管缺乏明显的线性序列相xf187 PT游戏似性。科学家合成了完整的人造LncRNA,xf187 PT游戏设计它们包括XIST中发现的KMER,同时确保分子的整体序列不同于任何已知的LncRNA。他们将他们的SEKR算法应用到这些人工的LNCRNs中,发现与Xist的预测功能相似性最高的人在XIST样活性xf187 PT游戏的简单试管测试中具有最高的实际功能相似度。</P> < P> Calabrese和他的同事们现在希望用KMER为基础的方法来指导发现和研究。LncRNA在癌症等疾病中很重要。他们还期望从他们的序列信息中提炼出更好的预测LNCRNs功能的方法。</P>< BuldQuut>> P>我们的基因组xf187 PT游戏产生了如此多的LncRNa,Calabrese说:“现在我们有了一个更好的想法,看看这些分子的序列是如何预测我们细胞中哪些分子在做重要的事情。”影子> > div类=“框内块”> i类=“TICOIN BOXICON”> </IKKKJM,基姆:Inoue KSmola MJLee DM谢尔泽博士Wooten JSBaker AR斯普拉格D科林斯DW霍宁CR王氏Chen Q周公里,Mucha PJ卡拉布雷斯(2018)K-Me含量长的非编码RNA的功能分类。</强> EM > Nat Genet </E兴发亚洲唯一官方网站M> [EPUB-PROB]。[HeRF= =“HTTPS://www. nutur.com /sOrths/S41588- 018-0207- 8”目标=“NoOnter NoeFror”>抽象< /DI>>/div > /div > IMG-SRC=“HTTPS://www-LnCRNabLog.COM/?”后置ID=7748“宽度=1”高度=“1”xf187 PT游戏样式=“显示:无”; HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com/科学主义-Real-Advay-MAP-广袤未知区域的长非编码-RNA/FEED/兴发亚洲唯一官方网站 LNCFWER——长非编码RNA识别的集成平台兴发亚洲唯一官方网站 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/LncFuner-AN-整合平台-FLAN识别/ RN-AdvixId/In兴发亚洲唯一官方网站 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /LncFiver:一个长非编码RNA识别/响应的集成平台兴发亚洲唯一官方网站 周一,13八月2018 11:13:07 + 0000 网络管理员 LNCRNA发现 预测 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7744 发现新的长非编码RNAs(LNCRNs)已兴发亚洲唯一官方网站成为LNCRNA相关研究的基本步骤xf187 PT游戏。如今,已经开发了许多基于机器学习的工具用于LNCRNA识别。然而,许多方法单独使用序列衍生的特征来预测Lncxf187 PT游戏RNs,在不同物种上表现出不稳定的表现。此外,大多数工具不能再培训或量身定做的用户… 发现新的长非编码RNAs(LNCRNs)已成为LNCRNA相关研究的一个基本步骤。xf187 PT游戏兴发亚洲唯一官方网站如今,已经开发了许多基于机器学习的工具用于LNCRNA识别。然而,许多方法单独使用序列衍生的特征来预测Lncxf187 PT游戏RNs,在不同物种上表现出不稳定的表现。此外,大多数工具不能被用户重新训练或定制,也不能定制或集成这些特征以满足研究者的要求。研究者从<HeRF=“HTTP://Gualal.jU.EnUcCN/USER/索引/索引”目标=“空白”Re=“NoNoReer-NordeFror”>吉林大学</A>全面回顾和评价了从序列内在成分中提取的特征,二级结构和理化性质。还开发了一个集成的平台LncFinder,以提高性能和促进LNCRNA识别的研究。LNCFIDER包括一个新的LNCRNA预测使用研究人员设计的异源特征。实验结果表明,该方法优于多个国家的最先进的工具,具有更强的鲁棒性和令人满意的结果。研究人员还可以使用LNCFUDER提取各种经典特征,利用多种机器学习算法构建分类器,有效、高效地评价分类器性能。LNCFONER可以从不同的角度揭示LNCRNA和mRNA的性质,并进一步激发LNCRNA蛋白相互作用预测和LNCRNA进化分析。可以预期,LncFinder可以显著促进LncRNA相关的研究,特别是对于未开发的物种,</P> < P风格=“强对齐>中心”>强> >/P>< P> >“大小满WP-图像-228 80对齐中心”SRC=“HTTPS://www. RaN-SqBL.G./WP-内容/上传/ 2018/08/LncFund.PNG”ALT=“RNA SEQ”宽度=“520”高度=“714”/></P> < P> < EM >数据集。从基因代码和集成。xf187 PT游戏每个基因只能使用一个转录本。除了序列内在成分之外,还利用两个特征选择方案从多尺度二级结构和基于EIIP的物化性质中提取特征。用10倍CV和ROC曲线评价获得了最优特征组合和机器学习算法,以开发一种新的LNCRNA识别方法。这种方法是针对五种五种常用工具的基准,它最终被包括在LncFinder,这是一个高度灵活的LNCNA识别和分析包。LNCFUTER发布为R包和Web服务器。</> > P><强>可用性< /强> -LNCFUTER作为R包发布(<HeRF=)http://cR.r.jord.org/Cys= LnCFuNe]目标=“空白”Re=“NoNoReNoreForver”>http://CRAN.r.Org/Cyp= LncFunter </A>)。Web服务器(<HeRF=)/http://bML.SDATS.EdU/LncFuneRe/“目标=“空白”Re=“NoNoReNoeFror”> http://bbl .SDt.EdU/LncFund/< A/>)也被开发以使其可用性最大化。<div>=“box阴影”> div类=“框内块”> i类=“TiICON BOXICON”> < I/> HANS S,Liang YMa QXu YZhang Y杜伟王丙李毅。(2018)<强> LncFunt:一个利用序列内在组成的长非编码RNA识别的集成平台,兴发亚洲唯一官方网站结构信息和物理化学性质< /强>。<EM >简要Biovivs/E> >打印前的EPUB。[HaRf://Actui.OUP.COM/BB/AdvaseToeLe/Doi/101093/BiB/BBY06/506950 ]目标=“NoLeuner-NoeFror”>文章< /DI>>/div > /div > IMGSRC=“HTTPS://www-LnCRNabLog.COM/?”后置ID=7744“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/LncFunder-AN-集成平台-RAP-Read /Field/Field/兴发亚洲唯一官方网站 基于NeXFLUT的RNA长链非编码RNA的识别和分析兴发亚洲唯一官方网站 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/LNCPIPE-A NEXFROWE-BASE流水线-识别和分析-长非编码-RNAS-FROM RN-SEQ-DATA/兴发亚洲唯一官方网站 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /LncPIPE-A nNeXFLUE基线管道识别和分析-长非编码-RNAS-FROM RN-SEQ-DATA/YAY响应兴发亚洲唯一官方网站 结婚,08八月2018 12:22:24+ 0000 网络管理员 管道分析 低压管道 NeXFLASH RNA序列 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7741 最近,长链非编码RNA分子(LNCRNA)因其在多种生物学过程中的重要作用以及在人类多种疾病和癌症中的重要作用而受到广泛关注。 < div alig=“正当”>最近,长链非编码RNA分子(LNCRNA)因其在多种生物学过程中的重要作用以及在人类多种疾病和癌症中的重要作用而受到广泛关注。LNCRNs的鉴定和分析是提高我们对其功能和调控机制的认识的基本xf187 PT游戏步骤。然而,RNA序列的LncRNA发现是有限的,由于复杂的操作和实施。研究人员在A HRFF=“HTTP://Eng.SySc.Or.CN/NoXX.ASPX”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>中山大学癌症中心< / A>已经开发了一个一站式管道,称为LncPube,专注于从原始转录组测序数据中鉴定LncRNs。xf187 PT游戏该管道是基于流行的工作流框架Nextflow开发的,由四个核心程序组成,包括读取对齐,装配,识别和量化。它包含各种独特的特征,如精心设计的LNCRAS注释策略,xf187 PT游戏优化计算效率分类和互动分析报告。此外,LnCube允许用户取消管道,从命令中重置参数或修改主脚本,并恢复从继续检查点的分析。<div/Algun=“DealStudio”>/div >“p对齐”=“中心”>“http://ARLS-CDN.CON/CONTEN/IMAGE/1-S2.0 S16738 518301176 GR1.JPG”目标=“空白”Re=“NoNoPER NOREFER”> IMG类=“大小满WP-图像-22565对中”SRC=“http://WW”。“2018”/“07”/“nc=”781“高度”=“972”/“< /a> </p> <强>可用性< /强> -LncPobe可在::“http://Github. COM/LILTEL/LNCtube”目标=“NoOnter NordeFror”> http://Github.com /LycButs/Lnxf187 PT游戏Ctube < /A> < /P> div类=“box阴影”> div类=“框内块”W.RNA-SeqBoo.COM/WP内容/上传> < i类=“TICOIN BOXICON”> </I> Zhao Q,太阳Y王德Zhang HYu KZheng J左慈(2018)<强> LncPobe:一个基于NeXFLUE的用于识别和分析RNA非编码RNA的长链非编码RNA <强>。兴发亚洲唯一官方网站<EM >基因组基因组学< E/EM > [EPUB]。[HaRf://www. SisturnDist.com/Simule/Poi/S167851718301176 ]目标=“空白”Re=“NoNoReer-NoeFror”>抽象< /DI> > /div > IMG SRC=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/”?后置ID=7741“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. LncNaxf187 PT游戏babLog.COM/LNCPIPE-A NEXFROWE-BASE流水线-识别和分析-长非编码-RNAS-FROM RN-SEQ-DATA/FEEP/兴发亚洲唯一官方网站 2个博士后职位-计算表观遗传学和非编码RNA分析兴发亚洲唯一官方网站 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.COM/2-POSS-TDOC定位-可用计算-表观遗传学和非编码RNA分析兴发亚洲唯一官方网站 http://www. Lncnabxf187 PT游戏ab.com /2-POS- TDOC位置-可用计算-表观遗传学和非编码-RNA分析/γ响应兴发亚洲唯一官方网站 结婚,11月2018日16:17:39+0000 网络管理员 乔布斯 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7735 分子生物学研究所是生命科学卓越的中心,由勃林格-英格尔海姆基金会资助。它位于… <> > <分子生物学研究所GIMBH(IMB)<强>是生命科学卓越中心,由勃林格-英格尔海姆基金会资助。它位于约翰尼斯古腾堡大学校园内,美因兹德国。Christof Niehrs教授的研究小组邀请了两位博士后研究人员来研究长非编码RNA在胚胎干细胞DNA去甲基化调节中的作用。兴发亚洲唯一官方网站参见Hyrf=“Htf://www-IMB-MeZ.De/Real-AT-IMB/NIEHSs/Realths/”目标=“空白”Re=“NoNoPER NORIEFER”>IMB/NIEHRS/De/研究/研究/ < A/< > /P> < P> <强>项目</St></P> < UL> < LI> RNA-Seq的分析,芯片SEQ利用自身和内部提供的管道DNA甲基化数据集</LI> < LI>非编码RNA结构的计算分析</L>>LI>从多个组学来源</LI> LI>中整合定量数据进行个性化后定量分析(如:兴发亚洲唯一官方网站GSEA与已发表的数据集相比)</LI> <LI>支持生物信息学技能的实验室成员</LI> </UL> <P> <强>您在生物信息学中有</强> </P> < UL> <LI:PHD;计算生物学,自然科学或相关领域</L> < LI> R脚本或Python的声音体验</L> < LI>熟悉大规模数据分析(RNA-Seq),优秀的沟通技巧和良好的团队合作精神,具有独立解决问题的能力;</LI>英语流利(口语和书面)</LI> </UL> <P><强>我们提供</St></P> < LU>国际化和充满活力的工作环境</LI> LI>有竞争力的薪酬</L> < LI>培训机会</L> < LI>青睐可退休金计划</LI> < /UL> < P> <强>开始日期:< /强> 31(SUP> ST </SUP> 2019年1月</P> < P> <强>持续期:</强>最初2年;适用于进一步扩展的选项</p> <p>申请,请发送一份<强> U>单< /U> <强> PDF文件,其中包含您的求职信,陈述研究和职业兴趣,简历扫描你的学位(德国人:包括Abutur-和Primo/主ZuGNIS副本),和2个引用的联系细节:< HRFF=“Melto:个人@ IMB美因兹.de”>人员@ IMB美因兹。非正式询问应向教授提出。Christof Niehrs(C.NIEHRSIMB美因兹DE).< P> > P> <强>结束日期:< /强> 30 > SUT/SUP> 2018年9月< /P> H4>同意声明和数据保护< /H4> < P>发送您的应用程序,您同意我们保存您的个人数据,以便执行选择过程。您可以在<HRFF=“http://www. imb. DE/JOBS/DATENSCHUTKELKULUNG数据保护/”目标=“ION空白”Re=“NoOnter NoeFror”> http://www. De/Jasks/DATEnStuutZelkeleRon数据保护/ </A> < /P> < IGG SRC=“http://www. LncnabLog.com/”的信息保护和保留周期的更多信息。后置ID=7735“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”;xf187 PT游戏 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bab.com /2-POS- TDOC位置-可用计算-表观遗传学和非编码-RNA分析/馈电/兴发亚洲唯一官方网站 转录调控蛋白编码序列残基的鉴定 HTLPS://www. LncNaxf187 PT游戏bab.com/识别-转录-蛋白质编码-序列-残留-在LNCRASN/ http://www. LncNabxf187 PT游戏ab.com .CON/LIcRNAM/α应答中转录蛋白编码序列残基的鉴定 结婚,11月2018日16:13:13+ 0000 网络管理员 管道分析 注释 HTTPS://www. Lncnaxf187 PT游戏bLog.COM/?P=7730 长基因间非编码RNAs(LNCR兴发亚洲唯一官方网站Ns)是非编码转录物>200个核苷酸,不与蛋白质编码序列重叠。重要的是,已知这些元素是组织特异性表达的,并在基因中发挥广泛的作用。 <长>基因间非编码RNAs(LNCRNs)是非编码转录物>200个核苷酸,不与蛋兴发亚洲唯一官方网站白质编码序列重叠。重要的是,已知这些元素是组织特异性表达的,并且在数千个基因组位点的基因调控中起着广泛的作用。然而,对于这些RNA元件的进化生物合成机制知之甚少,特别是考虑到它们在物种间的保护性差。已经提出,lincRNAs可能起源于假基因。对此进行系统测试,研究者在<HRFF=“HTTP://www-Biop.Un-MeZ.De/DexxEng.PHP”目标=“空白”Re=“NoNeNeer-NordeFror”>约翰尼斯古腾堡美因茨大学</A>开发了一种新的方法,用于寻找LcRNA转录本中蛋白质编码序列的残留物;假说是,我们可以追溯他们的生物发生从蛋白质编码基因或后转座子/反转录转座子插入。应用此方法,他们发现了203个人类LcRNA基因,其区域与蛋白质编码序列非常相似。这种方法提供了一个可视化工具来跟踪进化相关的生物合成的蛋白质编码基因的序列发散。随后,研究人员利用公共RNA Seq库展示了lincRNAs及其鉴定的亲本蛋白质编码基因的表达相关性。暗示新的基因调控关系。综上所述,他们已经开发了一种新的计算方法来研究非编码基因序列,兴发亚洲唯一官方网站可用于鉴定LcRNA的进化生物合成和功能。</P> < P风格=“文本对齐:中心;> <强>寻找LncRNA中蛋白质编码序列残存的方法> <强> >/P>> P> < HRTF://Actu.Out.Cop/VIEW/LIGUR/118596060/GKY608FIG1.JPG”目标=“空白”Re=“NoNoReer-NordeFror”>IMG-CLAS。S=“HTTPS://www. RNA-SEQBUG.COM/WP-内容/上传/ 2018/07/LIC-620X1024.PNG”ALT=“RNA-Seq”宽度=“620”高度=“1024”/> </A> </P> < P> <蛋白质编码基因(氨基酸序列)与非编码基因(DNA序列)比对的流程图:以下步骤:确定最长的COMMon子字符串,兴发亚洲唯一官方网站xf187 PT游戏然后在两个方向上扩展直到找到零概率事件。该过程在未对齐区域上迭代。然后,选择具有10个氨基酸的吲哚和/或错配的单块。最后,不同帧之间的边界被优化,最大化对齐得分是根据我们的评分矩阵</EM>< /P> < P> <强>可用性< /强> -用于获得LCRNA集合预测的开放软件(I类和II类),下一个GITHUB储存库中的每一个LcRNA都与它们相应的蛋白编码基因对齐(A类=“链接链接URI”):“http://Github. COM/SWTAURANAN/PrimSurnCnRNA”目标=“NoOnter NordeFror”> http://GITHUB.COM/SWTAURAN/PrtSurrCnRNA < /P> < div类=“box阴影”> DIV类=“Box Inn”ER块> > I类=“TiICON BOXICON”> </I> TALYANS S,Andrade Navarro MA穆罗EM.(2018)<强>转录蛋白编码序列残基的鉴定。<>核酸Res </EM> [EPUB在打印之前]。[HaRf://Acj.OUP.CON/NAR/Advang-ToeLe/DOI/101093/NAR/GKY608/505064 2 ]目标=“空白”Re=“NoOnter NoeFror”>文章< /DI>>/div > /div > IMTSRC=“HTTPS://www. LnCRNabLog.COM/”?后置ID=7730“宽度=1”高度=“1”样式=“显示:无”xf187 PT游戏; HTLPS://www-LnCRNaxf187 PT游戏bab.com/识别-转录-蛋白质编码-序列-残留-在LNCRASN/FEED//