lnc2meth–一个人工管理的数据库,其中记录了长非编码RNA与人类疾病相关DNA甲基化之间的调节关系。兴发亚洲唯一官方网站

LNC2METH,一种用于识别人类长非编码RNA(lncrnas)和DNA甲基化之间调节关系的交互式资源,xf187 PT游戏兴发亚洲唯一官方网站它不仅是对实验支持的lncrnas DNA甲基化关联的人工收集和注释,而且是一个平台,有效地集成了各种人类疾病中计算和识别差异甲基化lncrnas和蛋白质编码基因(pcgxf187 PT游戏s)的工具。

资源提供:

(i)高级搜索可能性,例如通过搜索感兴趣的lncrna符号检索数据库,DNA甲基化模式,调节机制和疾病类型;

(ii)为lncrnas和pcgs大量计算的DNA甲基化阵列图;xf187 PT游戏

(iii)根据患者临床数据计算的每个HIT转录的预后值;

(iv)显示特定类型疾病的lncrna转录物的DNA甲基化情况的基因组浏览器;

(v)用用户提供的外部数据集对lncrna位点的探针进行重新注释并识别lncrna和pcgs的不同甲基化模式的工具;xf187 PT游戏

(vi)一个R包(lncdm),用本地计算机完成差异甲基化lncrnas识别和可视化。xf187 PT游戏

lnc2meth的内容和接口

LNCRNA

A)人工组织lncRNA甲基化与lnc2meth的关联。()预测了lnc2meth中lncRNas和pcgs的差异甲基化模式。xf187 PT游戏(C)用于手动调节lncrna甲基化关联的调节模块。(D)寻找预测的lncrna/pcg甲基化模式。(e)DMbrowser模块,用于说明lncrnas和pcgs的甲基化情况。xf187 PT游戏(F)lncdm,在本地计算机上计算lncrnas和pcgs甲基化模式的R包。xf187 PT游戏()在线识别lncrnas和pcgs差异甲基化模式的工具模块。xf187 PT游戏

lnc2meth提供了一种及时且有价值的资源,可用于显著扩大我们对各种人类疾病中lncRNas和DNA甲基化之间调节关系的理解。xf187 PT游戏

可利用性http://www.bio-bigdata.com/lnc2meth/

智赫Li X王普Gao YGao B周D,张勇,郭M,Yue M沈伟宁斯金丽霞。(2017年) lnc2meth:一个人工整理的长非编码RNA与人类疾病相关DNA甲基化之间调节关系的数据库。兴发亚洲唯一官方网站 核酸研究[印刷前电子版]。[ 文章]

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