lncident–快速识别长非编码RNA的工具

越来越多的研究表明,长非编码RNA(lncrnas)在生物过程的多样性中起着关键作用,并与各种类型的疾病有关。xf187 PT游戏如何快速识别lncrnas和信使RNA是揭示lnxf187 PT游戏crnas识别功能的基本步骤。

研究人员吉林大学基于支持向量机模型,开发了一种利用序列固有成分特征和开放式阅读帧信息快速识别lncrna的新方法。xf187 PT游戏命名为lncident(lncrnasxf187 PT游戏标识)。采用10倍交叉验证和ROC曲线评价反应器的性能。本发明的主要优点是速度快,不损失准确度。与现有的流行工具相比,进取心强于编码电位计算器编码潜力评估工具编码非编码索引,和普莱克.它也比对潜在计算器进行编码和对非编码索引进行编码快得多。本品在微生物方面表现突出。为微生物分析提供了广阔的应用前景。此外,事件可以由用户自己收集的数据进行培训。此外,R包和Web服务器同时开发,以最大限度地为用户提供便利。

事件框架:包含数据收集,
特征提取,分类模型构造,和模型评估

LNCRNA

可利用性–R包“lncident”可在http://csbl.bmb.uga.edu/mirrors/jlu/lncident/index.php,适用于多种操作系统平台。可通过以下方式访问事件的Web服务器:http://csbl.bmb.uga.edu/mirrors/jlu/lncident/annotate.php.

汉斯Liang Y李Y杜威(2016) 事件:利用序列固有成分和开放阅读框信息快速识别长非编码RNA的工具。. 国际基因组学2016:918596.[ 文章]

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