xf187 PT游戏LncRNAs2Pathways -基于全球网络传播方法识别受一组感兴趣的lncrna影响的通路

长非编码R兴发亚洲唯一官方网站NA(lncrnas)已被证明在不xf187 PT游戏同的细胞过程和生物学功能中起着重要作用。探索与lncrnas相关的功能可能有助于洞察其潜在的生物学机制。xf187 PT游戏目前的方法主要侧重于研究单个lncrna的功能;xf187 PT游戏然而,重要的生物学功能可能受到多个lncRNA的组合效应的影响。xf187 PT游戏

在这里,的研究人员哈尔滨医科大学开发了一种新的计算方法,xf187 PT游戏LncRNAs2Pathways,基于全局网络传播算法识别一组感兴趣的lncRNa组合效应影响的功能路径。xf187 PT游戏一种新的基于网络传播分数加权的kolmogorov - smirnovlike统计测度,考虑lncrna与编码基因的表达相关性,xf187 PT游戏被用来评估受感兴趣的lncRNas影响的生物学途径。xf187 PT游戏研究人员描述了lncrnas2路径方法,并通过分析与胶质瘤相关的三组lxf187 PT游戏ncrna来说明其有效性。前列腺癌和胰腺癌。进一步分析了该方法的重现性和鲁棒性,并与其他两种方法的结果进行了比较。根据这些分析,他们表明,lncrnas2通路能有xf187 PT游戏效识别与lncrna相关的功能通路。

lncrnas2通道流程图xf187 PT游戏

LNCRNA

步骤1。结合RNA序列数据和蛋白质-蛋白质相互作用数据构建CNC网络。步骤2。一组感兴趣的lncxf187 PT游戏rna被映射到基因相关网络,利用全局网络传播算法计算蛋白质编码基因的传播分数,这反映了基因受lncrnas影响的程度。xf187 PT游戏根据繁殖分值构建蛋白编码基因序列。步骤3。将给定通路中的蛋白编码基因映射到排序后的蛋白编码基因列表,e (P)是通过遍历列表来计算的。进行置换试验,以确定具有统计学意义的通路。

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韩杰,刘,太阳Z张Y,张,张C,Shang D杨H,苏菲Xu Y李C,仁和李X。(2017) xf187 PT游戏lncrnas2路径:基于全局网络传播方法识别受感兴趣的一组lncrnas影响的路径Sci代表7:46566。[ 文章]

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