巨蟹座的长链非编码RNA人口普查兴发亚洲唯一官方网站

长非编码R兴发亚洲唯一官方网站NA(lncRNAs)是癌症基因组xf187 PT游戏学研究的日益重视,创造lncRNAs与验证癌症作用的资源的需求。此外,它仍有争议突变lncRNAs是否可以驱动肿瘤发生,以及是否这样的功能可以在进化过程中是保守xf187 PT游戏的。在这里,作为部分ICGC /全基因组的TCGA泛癌症研究(PCAWG)联盟,伯尔尼大学研究人员介绍癌症LncRNA人口普查(CLC),122个GENCODE lncRNAs的与癌症表型的因果作用xf187 PT游戏的汇编。相较于现有的数据库,CLC需要强大的功能性或遗传证据。CLC基因富集之中从体细胞突变,并显示特性的基因组特征的预测驱动的基因。引人注目的是,CLC基因富集从小鼠不带偏见,全基因组转座子诱变筛选驱动突变。研究人员确定了10个肿瘤致病突变在8个lncRNAs的直系同源物,包括xf187 PT游戏LINC品脱利落, 但不是MALAT1。因此,CLC代表高可信度的癌症lncRNAs的数据集。xf187 PT游戏诱变地图是用于识别在肿瘤发生中的lncRNAs深深保守角色的新颖的装置。xf187 PT游戏

癌症LncRNA人口普查的概述

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行表示122个CLC基因,列表示29的癌症类型。星号旁边基因名称表明他们被预测为通过PCAWG司机,对基因或启动子的证据或者依据(见补充资料1)。Blue细胞指示给定lncRNA的癌症类型的介入的证据。左侧栏表示功能分类:肿瘤抑制(TSG),致癌基因(OG)或二者(OG / TSG)。上方和右侧,barplots表示每个列/行的总计数。饼图显示,CLC GENCODE V24 lncRNAs中代表的比例。xf187 PT游戏需要注意的是8个CLC基因被归类为“假”的GENCODE。“nonCLC”指所有其他GENCODE标注lncRNAs,其被用作比较分析的背景。xf187 PT游戏

这项研究是发表在Nature如被称为1300名科学家组成的国际合作的一部分基因组全泛癌症研究(PCAWG)

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Carlevaro-菲塔Ĵ,LanzósA,费尔巴哈L,香C,马斯-蓬d,彼得森JS;PCAWG驱动程序和功能口译组,约翰逊R,PCAWG联盟。(2020)癌症LncRNA人口普查揭示在肿瘤长非编码RNA的深厚的功能保护证据。COMMUN生物学3(1):56。[文章]

该ICGC / TCGA泛癌症基因组全联盟的分析。(2020)全基因组的泛癌症分析。性质578:82-93 [文章]

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